MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_6

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009789	A	6	6	29	34	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009789	ATCT	2	8	174	181	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009789	GCT	2	6	206	211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009789	G	6	6	292	297	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009789	CCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_009789	G	6	6	521	526	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009789	TCT	2	6	565	570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009789	CCGTCC	2	12	607	618	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_009789	CGC	2	6	635	640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009789	CTG	2	6	706	711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149501
11	NC_009789	TGC	2	6	721	726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149501
12	NC_009789	T	6	6	728	733	0 %	100 %	0 %	0 %	157149501
13	NC_009789	AAC	2	6	847	852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009789	ATG	2	6	890	895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149500
15	NC_009789	AAC	2	6	896	901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149500
16	NC_009789	T	7	7	1145	1151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009789	AAT	2	6	1220	1225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009789	A	7	7	1270	1276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009789	TTC	2	6	1318	1323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009789	CAT	2	6	1392	1397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009789	GAA	2	6	1545	1550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009789	CATG	2	8	1618	1625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009789	GGT	2	6	1665	1670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009789	TTG	2	6	1671	1676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009789	T	7	7	1813	1819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009789	GTT	2	6	1862	1867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009789	CTC	2	6	1872	1877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_009789	CTG	2	6	1938	1943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009789	CTG	2	6	1959	1964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009789	CCT	2	6	2018	2023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_009789	T	6	6	2104	2109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009789	TG	3	6	2196	2201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009789	TG	3	6	2229	2234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009789	CAG	2	6	2248	2253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009789	A	6	6	2314	2319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009789	GTA	2	6	2347	2352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009789	TA	3	6	2365	2370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009789	GGT	2	6	2458	2463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009789	ATG	2	6	2495	2500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009789	GGT	3	9	2539	2547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009789	TGG	2	6	2550	2555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009789	ATA	2	6	2561	2566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009789	TCA	2	6	2600	2605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009789	GAA	2	6	2637	2642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009789	CTG	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009789	TAA	2	6	2673	2678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009789	CAT	2	6	2686	2691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009789	CTGG	2	8	2756	2763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009789	GGCA	2	8	2778	2785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009789	TGTA	2	8	2827	2834	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009789	GGC	2	6	2872	2877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009789	CGGGAT	2	12	2891	2902	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009789	GAA	2	6	3035	3040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009789	GCGG	2	8	3051	3058	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009789	GCG	2	6	3160	3165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009789	GCC	2	6	3179	3184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009789	TGA	2	6	3193	3198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009789	AAC	2	6	3210	3215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009789	CTC	2	6	3429	3434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149503
60	NC_009789	GA	3	6	3521	3526	50 %	0 %	50 %	0 %	157149503
61	NC_009789	GTC	2	6	3570	3575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149503
62	NC_009789	GGC	2	6	3603	3608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149503
63	NC_009789	CCAG	2	8	3650	3657	25 %	0 %	25 %	50 %	157149503
64	NC_009789	ATG	2	6	3673	3678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149503
65	NC_009789	ATG	2	6	3684	3689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149503
66	NC_009789	TCA	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149503
67	NC_009789	CGC	2	6	3750	3755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149503
68	NC_009789	ATC	2	6	3789	3794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149503
69	NC_009789	GC	3	6	3795	3800	0 %	0 %	50 %	50 %	157149503
70	NC_009789	GA	3	6	3941	3946	50 %	0 %	50 %	0 %	157149503
71	NC_009789	CTCCC	2	10	4010	4019	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
72	NC_009789	TCA	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009789	TCT	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009789	GGC	2	6	4195	4200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009789	AAGGC	2	10	4242	4251	40 %	0 %	40 %	20 %	157149502
76	NC_009789	GC	3	6	4302	4307	0 %	0 %	50 %	50 %	157149502
77	NC_009789	CTG	2	6	4378	4383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149502
78	NC_009789	GCC	2	6	4390	4395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149502
79	NC_009789	CCA	2	6	4435	4440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149502
80	NC_009789	AAC	2	6	4472	4477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149502
81	NC_009789	GCG	2	6	4546	4551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149502
82	NC_009789	AAG	2	6	4572	4577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149502
83	NC_009789	TGC	2	6	4689	4694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149502
84	NC_009789	CAGA	2	8	4729	4736	50 %	0 %	25 %	25 %	157149502
85	NC_009789	GCC	2	6	4740	4745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149502
86	NC_009789	TCC	2	6	4791	4796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149502
87	NC_009789	TGA	2	6	4804	4809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149502
88	NC_009789	CGG	2	6	4878	4883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149502
89	NC_009789	CAC	2	6	4918	4923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149502
90	NC_009789	A	8	8	4988	4995	100 %	0 %	0 %	0 %	157149502
91	NC_009789	TGA	2	6	5032	5037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009789	TTTC	2	8	5089	5096	0 %	75 %	0 %	25 %	157149499
93	NC_009789	GCC	2	6	5100	5105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149499
94	NC_009789	GT	3	6	5141	5146	0 %	50 %	50 %	0 %	157149499
95	NC_009789	GCG	3	9	5169	5177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149499
96	NC_009789	GC	4	8	5233	5240	0 %	0 %	50 %	50 %	157149499
97	NC_009789	ACAG	2	8	5259	5266	50 %	0 %	25 %	25 %	157149499
98	NC_009789	AGC	2	6	5336	5341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149499
99	NC_009789	A	6	6	5348	5353	100 %	0 %	0 %	0 %	157149499
100	NC_009789	GC	3	6	5417	5422	0 %	0 %	50 %	50 %	157149499
101	NC_009789	CGC	2	6	5432	5437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149499
102	NC_009789	ATG	2	6	5448	5453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149499
103	NC_009789	CTGC	2	8	5479	5486	0 %	25 %	25 %	50 %	157149499
104	NC_009789	ACG	2	6	5508	5513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149499
105	NC_009789	GAT	2	6	5523	5528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149499
106	NC_009789	CAC	2	6	5590	5595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149499
107	NC_009789	CGAG	2	8	5635	5642	25 %	0 %	50 %	25 %	157149499
108	NC_009789	CG	3	6	5688	5693	0 %	0 %	50 %	50 %	157149499
109	NC_009789	GCG	2	6	5718	5723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149499
110	NC_009789	ATG	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149499
111	NC_009789	TAA	4	12	5899	5910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009789	ATG	3	9	5989	5997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009789	AAAT	2	8	6015	6022	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009789	AT	3	6	6021	6026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009789	TC	3	6	6029	6034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009789	AT	3	6	6044	6049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009789	T	6	6	6055	6060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009789	CTT	2	6	6062	6067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009789	TGC	2	6	6071	6076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009789	TCT	2	6	6179	6184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.